BIF

Algorithmique du texte et BioInformatique

Objectifs

L’unité a pour but de présenter les différentes problématiques rencontrées par les bioinformaticiens et les solutions algorithmiques mises en œuvres. L’objectif est de donner aux étudiants les clefs pour comprendre les interactions entre la biologie (où les règles ne sont jamais absolues) et l’informatique (qui est une science plus booléene).

Compétences acquises

L’enseignement proposera une introduction générale à la bioinformatique (enjeux et défis). Ensuite l'enseignement se focalisera sur des problématiques précises soulevées par l’analyse des génomes. Dans ce cadre, l'algorithmique du texte et plus précisément les techniques de recherches et d’indexation dans les masses de données génomiques seront présentées ainsi que les techniques de calculs de similarité entre séquences.

Responsable

Pierre Peterlongo (pierre [dot] peterlongoatinria [dot] fr)